Bowtie загрузить

"Bowtie очень быстро, эффективно использует память краткий Aligner читать"
Bowtie очень быстрый, эффективный памяти Aligner короткий читать. Он () для генома человека, в размере 25 миллионов читателей в час является типичной рабочей станции с 2 гигабайтами памяти, читает и выравнивает коротких последовательностей ДНК. Генома Барроуза-Уилера индекса Bowtie индексы собственной памяти, чтобы сохранить структуру мала: 1,3 ГБ для генома человека. Но гораздо быстрее перестройки эквивалентную Maq и мыло поддержка: О 35x быстрее, чем Maq и с течением времени генома человека 350X быстрее, чем согласование SOAP.

---

Особенности:
Исправлены все известные проблемы --unfa/--unfq страницу:
Нитки больше не работает должным образом тоже.
Исправлен баг, когда иногда противоположные позиции и были Quals.
Исправлены другие вопросы и мошеннических причины бездействия невыровненных читает.
Добавлено-м --maxfa/--maxfq предела, потому что не отдельные параметры, которые могут быть приняты для согласования гласит, которые присоединяются к любому читателю.
Выравнивание выходной сейчас "гарантированно будет детерминированной даже несколько потоков используется. Так что, учитывая тот же ввод в любом порядке (), и в то же - семена, бабочки, но не обязательно в том же порядке каждый раз при запуске той же последовательности будет производить читатели. Это не проводить между различными версиями Bowtie.
Несколько другой исправляет ошибку. Теперь вы можете скачать бесплатную Bowtie 0.9.9.3.