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Descripción

"Bowtie muy veloz, memoria eficiente Alineador corto leer"
Bowtie Alineador muy veloz, eficiente de la memoria es una lectura corta. No () para el genoma humano a un ritmo de 25 millones de lectores por hora es una estación de trabajo típica con 2 gigabytes de memoria lee y se alinea secuencias cortas de ADN. Con un genoma de Burrows-Wheeler índice de índices Bowtie su propia memoria para mantener la estructura de pequeña: 1,3 GB para el genoma humano. Pero mucho más rápido las políticas de ajuste equivalente Maq y SOAP apoyo: aproximadamente 35x más rápido que Maq y con el tiempo el genoma humano de 350x más rápido que la alineación de SOAP.


Características:
Se corrigieron todos los problemas conocidos --unfa/--unfq opciones:
Las discusiones ya no funciona correctamente también.
Solucionado el problema que a veces la posición opuesta y se les quals.
Problemas resueltos de otros y la omisión fraudulenta causas no alineados lee.
límite de Alta-m porque no --maxfa/--maxfq opciones distintas que se pueden tomar para alinear dice que se alinean con cualquier lector.
La alineación de salida ahora "se garantiza que sea determinista, incluso varios subprocesos se utilizan Así, dada la misma entrada en cualquier orden () y lo mismo en -. semillas, corbatín, pero no necesariamente en el mismo orden cada vez que ejecute las secuencias mismo producir los lectores. Esto no se sostiene entre las diferentes versiones Bowtie.
Múltiples correcciones de errores de otros. Ahora se puede descargar gratis Bowtie 0.9.9.3.

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